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hsa-miR-145-5p在胰腺癌中的表达及生物信息学分析

杨立涛 俞鹏飞 戴丐国 杜义安

杨立涛, 俞鹏飞, 戴丐国, 杜义安. hsa-miR-145-5p在胰腺癌中的表达及生物信息学分析[J]. 中华全科医学, 2017, 15(5): 755-758. doi: 10.16766/j.cnki.issn.1674-4152.2017.05.008
引用本文: 杨立涛, 俞鹏飞, 戴丐国, 杜义安. hsa-miR-145-5p在胰腺癌中的表达及生物信息学分析[J]. 中华全科医学, 2017, 15(5): 755-758. doi: 10.16766/j.cnki.issn.1674-4152.2017.05.008
YANG Li-tao, YU Peng-fei, DAI Gai-guo, DU Yi-an. Expression of hsa-miR-145-5p in pancreatic cancer and its bioinformatics analysis[J]. Chinese Journal of General Practice, 2017, 15(5): 755-758. doi: 10.16766/j.cnki.issn.1674-4152.2017.05.008
Citation: YANG Li-tao, YU Peng-fei, DAI Gai-guo, DU Yi-an. Expression of hsa-miR-145-5p in pancreatic cancer and its bioinformatics analysis[J]. Chinese Journal of General Practice, 2017, 15(5): 755-758. doi: 10.16766/j.cnki.issn.1674-4152.2017.05.008

hsa-miR-145-5p在胰腺癌中的表达及生物信息学分析

doi: 10.16766/j.cnki.issn.1674-4152.2017.05.008
基金项目: 

浙江省医药卫生科研基金(2017KY251)

浙江省中医药管理局基金(2016ZB026)

详细信息
    通讯作者:

    杜义安,E-mail:surylt@hotmail.com

  • 中图分类号: R735.9

Expression of hsa-miR-145-5p in pancreatic cancer and its bioinformatics analysis

  • 摘要: 目的 研究hsa-miR-145-5p在胰腺癌患者及正常人血浆中的表达模式,探究hsa-miR-145-5p作为胰腺癌诊断标记物的可行性。进一步阐明其在胰腺癌的发生发展过程中可能的调控机制。 方法 采用生物信息学方法进行hsa-miR-145-5p的靶基因预测及功能分析,选择miRanda、TargetScan和RNAhybrid三种软件预测hsa-miR-145-5p的靶基因并结合现有数据库筛选有实验数据支持的靶基因,进一步进行GO功能富集分析,KEGG Pathway富集分析和蛋白互作分析,研究靶基因功能。qPCR验证胰腺癌患者及正常对照组血浆中hsa-miR-145-5p表达。 结果 hsa-miR-145-5p序列在各物种间高度保守;预测其靶基因共得到8 679个,且有实验数据支持靶基因有1 408个;有实验数据支持的靶基因GO富集分析主要显著富集于胞内运输、基因表达调控、细胞内信号传导、细胞生长调控、能量代谢等生物学过程和功能上(FDR<0.01)。KEGG Pathway富集分析靶基因显著富集于p53信号通路、ErbB信号通路、MAPK信号通路、慢性骨髓白血病、膀胱癌、胶质瘤、前列腺癌、胰腺癌等(P<0.01),表明hsa-miR-145-5p在胰腺癌中有重要的调控作用。相较于正常组,患病组hsa-miR-145-5p表达下调。 结论 hsa-miR-145-5p调控多个肿瘤发生相关的基因,在胰腺癌发生相关的生物学过程中具有重要的调控功能,为胰腺癌miRNA标记物的研究提供了线索。

     

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出版历程
  • 收稿日期:  2016-10-20
  • 网络出版日期:  2022-08-06

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